“科学的内涵、公园的外貌、生态休闲的场所”是杭州植物园在新世纪的功能定位。杭州植物园在建设中也始终遵循生态保护的原则，在新建专类园时，尽量避免对 原有植被和生态群落的破坏，尽可能多地营造模拟自然的生态环境，构建了适于各类植物和小动物生存的环境。在植物园里，树龄几百年的古树名木随处可见，各种 鸟类无拘无束地在枝头高歌，百草园、分类区、森林公园等专类园更是成为了生物多样性的示范园。除此之外，杭州植物园还拥有大片未开发的自然山林，遍地野 花、野果，小动物时常出没，漫步其中，野趣盎然，使杭州植物园成为了都市中难得的世外桃源。